Hầu hết dân cư sống bằng nông nghiệp, canh tác trồng lúa nước, diện tích đồng lúa là 1.429 ha (hơn 14 km2).[7] Xã đã được chứng nhận sản xuất và chế biến gạo đạt tiêu chuẩn GlobalGAP (sản xuất nông nghiệp tốt toàn cầu) vào năm 2009.[8] Ðây là chứng nhận GlobalGAP đầu tiên của Việt Nam và các nước sản xuất lúa gạo ở Ðông Nam Á.[8][9][10] Các giống lúa chất lượng cao được trồng là OM 4900 và OM 5451 trong 3 vụ Đông Xuân, Xuân Hè và Hè Thu, năng suất 70 tạ/ha (7 tấn/ha),[11] cao nhất là 9 tấn/ha.[12]

Xã có 2 hợp tác xã là Hợp tác xã Mỹ Thành[13][14] và Hợp tác xã nông nghiệp Mỹ Thành Nam.[13] Hợp tác xã nông nghiệp Mỹ Thành Nam đi đầu trong việc trồng lúa đạt tiêu chí GlobalGAP và liên kết doanh nghiệp bao tiêu theo mô hình "Cánh đồng lớn" hằng trăm ha ruộng lúa.[13] Gạo chất lượng cao của xã đã được đặt Thương hiệu "gạo Mỹ Thành", được xuất khẩu sang nhiều nước.[9] Khó khăn của sản xuất lúa là đầu ra thị trường không phải lúc nào cũng ổn định, giá cả bấp bênh, thậm chí không bán được trong một số giai đoạn.[15]

Mỹ Thành Nam cũng được chọn làm thí điểm nhiều mô hình ứng dụng khoa học công nghệ vào sản xuất, như: Chương trình "Sức khỏe hạt giống", Chương trình "Quản lý chuột cộng đồng", Chương trình "Cánh đồng lúa sạch", Chương trình "3 giảm, 3 tăng" và chương trình "Xây dựng quy trình sản xuất lúa chất lượng cao, an toàn" (CLC, AT).[7] Từ năm 2017, Trạm Khuyến nông tỉnh Tiền Giang phối hợp Hội Nông dân xã Mỹ Thành Nam (huyện Cai Lậy) triển khai thí điểm cho nông dân trên địa bàn xã "Nuôi lươn thương phẩm không bùn an toàn sinh học" và đã đạt hiệu quả kinh tế.[16] Nông dân địa phương chuyển dần sang hướng đa dạng hóa trong sản xuất nông nghiệp, bên cạnh trồng lúa còn kết hợp nhiều mô hình, như: mô hình trồng lúa chất lượng cao kết hợp trồng cây ăn trái, mô hình nuôi ếch kết hợp cá nước ngọt, mô hình trồng lúa chất lượng cao kết hợp chăn nuôi gia súc.[17]

Xã có hai trung tâm mua bán lớn là chợ Bà Tồn nằm trên Quốc lộ 1A, con đường là ranh giới phía nam của xã Mỹ Thành Nam với xã Phú An, chợ thứ hai là chợ Ngã Năm nằm ở phía đông,[lower-alpha 1] thuộc khu vực ngã năm của 5 con sông, tiếp giáp với xã Phú Nhuận. Thu nhập bình quân đầu người của xã là 50 triệu đồng (VND)/năm.[18]